Efter en rad av människan skapade katastrofer har planeternas ekologi försämrats avsevärt, och det har blivit svårt för människor att leva. Mutanter dök upp som snabbt anpassade sig till nya förhållanden. Deras blod kan bli grunden för att skapa ett vaccin som hjälper vanliga människor att bli starkare och friskare. Hjälten i spelet Mutant Blood är en världsberömd vetenskapsman som förenade alla smarta huvuden på planeten för att skapa ett vaccin. Arbetet har börjat i alla hemliga laboratorier, men de som vill störa processen i Mutantblood har dykt upp - det är extremister.
